廠商申報營利事業所得稅虧損扣除額，若未如期繳納應繳稅額，仍無法享有虧損可列報扣除權益。台南某家廠商因未如期繳納應繳稅額，南區國稅局即以此為由未准許該公司將虧損列報年度扣除額，並核定虧損年度扣除額為零，廠商雖不服提起行政訴訟，高雄高等行政法院最後仍判決該公司敗訴。 南區國稅局表示，公司組織營利事業如欲依所得稅法第39條規定，列報前五年核定虧損本年度扣除額，除應具備會計帳冊簿據完備，虧損及申報扣除年度均使用第77條所稱藍色申報書或經會計師查核簽證外，還應注意必須依所得稅法第71條第1項規定，如期辦理申報並繳納稅款者，才准予扣除。 台南該廠商是在辦理90年度營利事業所得稅結算申報時，列報前五年核定虧損該年度扣除額2,395萬元，申報扣除90年度營所稅經過會計師查核簽證，且於91年5月31日辦理結算申報，但結算申報時並未如期繳納應繳稅額200萬元，因而被南區國稅局否准扣除，並核定前五年核定虧損該年度扣除額為零。 但廠商不服，主張虧損及申報扣除90年度都經會計師查核簽證並如期申報，已符合所得稅法第39條規定，應准將其核定前五年各期虧損，自90年度純益額中扣除，再行核課營利事業所得稅，且國稅局所說未如期繳納稅額200萬元一事，公司已經以代表人所有的土地來擔保公司滯欠稅捐。 經廠商提起行政訴訟，高雄高等行政法院仍判決該公司敗訴，理由是：該公司雖如期申報，但結算申報時並未依所得稅法第71條第1項規定，如期繳納應補繳稅額200萬元，經國稅局依行政執行法第13條規定，將滯欠稅捐案移送行政執行處時，其代表人才具文申請以其所有土地擔保公司滯欠稅捐，並由公司開立23張支票分期繳納，因此該公司顯然並未符合所得稅法第39條「如期申報」要件，國稅局否准扣除該公司前五年核定虧損，並核定前五年核定虧損90年度扣除額為零並無違誤。