財政部一聲令下，各地區國稅局已開始大動作查核二聯式統一發票短漏報銷售額，其中南區國稅局更是大有斬獲，迄今轄內已有66家公司自動補繳，短漏報銷售額更高達5.5億元。 南區國稅局表示，自去年在台南市發現有公司行號利用二聯式收銀機開立統一發票進銷項不易勾稽的特性，在每期申報營業稅時，故意短漏報已開立發票的銷售額，企圖逃漏營業稅。為有效防堵公司行號以多報少的不法逃漏稅行為，南區國稅局所屬17個分局、稽徵所從去年11月21日起，積極查核，目前為止共有66家公司自動補繳，短漏報銷售額高達5.5億元，可見此種逃漏稅型態非屬個案，而是一種普遍的現象。 按稅捐稽徵法第48條之1規定，凡未經檢舉或調查，而是納稅義務人自動向稅捐稽徵機關補報並補繳所漏稅款者，可享有只要加計利息、免處以漏稅罰的優惠，由於財政部並已將「使用二聯式收銀機統一發票短漏報銷售額案件」，列為今年度營業稅選案查核作業加強查核的項目之一。 除了南區國稅局外，其他各地區國稅局也在同步加強查核，過去如有短漏報銷售額的公司行號，應儘速自動補報補繳稅款，否則一旦國稅局開始進行調查，不但要補稅外，還要再按所漏稅額處兩倍罰鍰，後續還有營利事業所得稅的補稅處罰，都會接踵而來。