中央研究院和成功大學有意展開更積極的合作，包括共同指導研究生、合聘教授、共同邀請國際級大師來台、合作成立學程等。 中研院院長翁啟惠日前與3位副院長一起拜訪成大校長、前中研院副院長賴明詔，討論未來合作事宜。翁啟惠指出，目前雙方最可能合作的是台灣研究學程，因為成大已有台灣研究相關系所、社會研究、規畫與設計學院等，都包含與台灣研究相關的元素。 除此之外，成大的工程與材料、電射、光電、資訊等領域，也都很強，雙方會設法建立合作機制；還可加強基礎醫學領域的合作，可積極進行與醫學院有關技術的開發與合作。 翁啟惠說，中研院有意和各大學合作成立學程，未來或許可透過開放式教學，例如網路教學、遠距教學或共同指導研究生等方式合作；也可合聘人員、儀器共享，他說目前中研院借聘到成大的研究員很多，成大借聘到中研院比較少，未來可建立互相借聘的機制。