對於衛生署醫師懲戒覆審委員會報告，台北市立聯合醫院仁愛院區神經外科總醫師林致男低調表示，衛生署的報告考慮到醫療制度面的問題，對他來說比較公平，但這只是行政懲處，未來還有訴訟的路要走，不想再多說。 有媒體報導他要考專科醫師執照，做無國界醫師。林致男說，還沒做到的事，先不要講較好。 衛生署從輕發落邱小妹事件的兩位當事醫師，台北市醫師懲戒委員會主任委員、台北市副市長葉金川說：「我不能改變衛生署的決定，就讓社會公評吧!」 當初台北市醫懲會認為，林致男違反醫師法，擅自將診療紀錄加寫到病歷上，又辯稱曾看過女童腦部斷層X光片，以違反醫師法第24條第4款「執行業務違背醫學倫理」，做出停業半年及進修20小時醫學倫理課程決議。 另一位當事醫師，仁愛院區神經外科主治醫師劉奇樺則因嚴重違背督導職責，也以違反同款規定，被處停業三個月及進修20小時醫學倫理課程。 衛生署以制度面為由只給兩位醫師警告處分，葉金川認為，很多犯罪的背後都有不合理的制度。例如一個人因為肚子餓去搶劫，犯罪還是犯罪，不能因為他有理由就不罰。衛生署以制度不合理為由輕罰，邏輯有點奇怪。