對於中研院長李遠哲提出的教改省思萬言書，教育部長黃榮村昨晚表示，他還沒看過內容，不便發表任何意見，全國教師會理事長呂秀菊則認為李遠哲所領軍的教改會，提出的教改意見空有理想、沒有規劃，難保後頭執行的人不會拿著雞毛當令箭，來倉卒行事。 呂秀菊說，教師也認同李遠哲關心教育的心，李遠哲在「關於教育改革的一些省思」中提出的說明也都沒有偏差，但李遠哲既然知道教改是一個全面性、大規模的改革，就應該可以預見會造成問題。 呂秀菊說，雖然李遠哲在文中批評教育部推動教改過於躁進，但教改諮議報告書裡頭也只有提「理想」，卻沒有列出步驟以及階段性應達成的任務，造成理想卻變成與實務上不可能達成的「夢想」。 呂秀菊說，李遠哲認為教師自主才能負更多責任，但卻沒有想到是否提供充足的資源讓教師自主，到目前為止，當年倡議教改的人及教育部都還沒有把現在教改的「技術性問題」說清楚講明白，卻讓教師每天面對問題，對教師很不公平。 對於李遠哲批評多元入學方案中「申請入學」管道急就章實施，全國家長團體聯盟理事長蕭慧英說，申請入學制度是實現社會多元價值的重要一環，只是實施之初，家長與學生為了多爭取入學機會，且申請入學名額也多，才會造成爭破頭、勞民傷財、不公平等亂象，現在申請入學名額已經降低，家長也大多傾向肯定其多元精神，李遠哲應該多舉出些實證，證明申請入學制度是否真如他所言是失敗的才對。