國中與補教界自然教師昨天同聲批評，今年基測自然科考題缺乏創意，至少有21題類似坊間參考書或往年考試的題目，部分題目計算題解題過程繁複，有的考題屬於教育部統一編輯時代的舊教材內容。整體而言，第二次基測比第一次難，程度好的考生錯4題，中等可能錯13~15題。 補教界自然教師楊過批評，第57、58題有關波波持續一年在正午時間觀察太陽在天空中位置的試題，此題觀念並未出現在任何一版本的教科書，但是南一、康軒版的教師手冊則有補充這樣的概念，師大附中國中部段考則出過類似的考題，如果老師曾做補充教學，考生就易於解題，否則對考生相對不公平。 坪林國中張錫勳校長指出，自然科第10、11、14、16、24、29、33、34、35、36、39、40、42、47、48、50及51題等17題，類似坊間參考書的題目；而台北市蘭雅國中自然科教師高永遠說，第8、19、49及51題等4題，往年聯考或參考書都有類似題，考生會覺得似曾相識，命題缺乏原創性。 近幾年來自然科較少出現繁複的計算題，高永遠說，第26、34、37題的計算都偏難，且過程複雜，對考生考驗頗高。