縣環保局調查，日月潭涵碧樓、大淶閣等少數觀光飯店有簡易汙水處理設施外，多數餐飲業都直接將汙水排入潭中，自來水公司長期取用日月潭水當自來水源，遭用戶詬病，日月潭水質檢測應嚴格把關。 「到底是那一家餐飲業的汙水管排入日月潭中？」一直是日月潭各餐飲業的「商業機密」，多數把汙水管深入日月潭底，許多住日月潭畔的居民，也不知道到底何處才有汙水管，但大家都深信日月潭水逐漸汙染中。 魚池鄉長廖學輝與代表會不斷接到民眾陳情，因為自來水公司長期取日月潭的潭水當自來水源，街坊鄰居患癌症死亡，親友都流傳與長期飲用日月潭水有關，令水公司百口莫辯。 魚池鄉公所秘書黃有來說，已知有不少人患結石赴埔里鎮基督教醫院就醫，「到底是否跟飲用日月潭水有關？」在鄉民間流傳。 魚池村長盧幸助說，隨大陸觀光客大批到日月潭，餐飲業及遊客製造的汙染越來越嚴重，難怪自來水用戶都很緊張。 日月潭國家風管處已著手日月潭汙水處理廠興建工程，分別要在伊達邵及水社興建各一座，目前水社已開工。自來水公司埔里鎮營運所也表示改善誠意，最近與魚池鄉長廖學輝、代表會等會勘東光村的水源地，如果取得土地，就著手鑿井測設工程。