雲林沿海至今沒有漁業權，養殖漁民遭受天然災害，求助無門，引發無數抗爭。縣府農業局計畫在離島工業區預定地以南的沿海地區，規劃近海養殖區，讓漁民登記漁業權，以解決多年來沒有漁業權引發的爭議。 雲林縣狹長海岸線，沙洲遍布，有如天然屏障，構成一個面積遼闊的內海，退潮後的泥質灘地，則是牡蠣的重要產地。但是，養蚵漁民一直沒有漁業權，遇到天然災害或遭受汙染，受害的養殖漁民索賠無門，蒙受慘重損失。 養殖漁民林金指出，離島工業區開發案，造成蚵苗無法著床，多年來索賠案都沒有結果，蚵民因為沒有漁業權，曾被環保署公害糾紛裁決委員會裁決駁回；問題是，政府根本沒有漁業權讓漁民申請，卻以此駁回他們公害求償案，相當不合理。 雲林區漁會總幹事林傳育表示，其他縣市大多劃設有漁業權範圍，保障養殖漁民權益。反觀雲林縣，長期沒有漁業權，養殖漁民遭受天然災害，也無法申請救助。 他說，去年敏督利颱風風災，造成蚵民損害，區漁會向縣府申請天然災害救助，卻因漁業權問題，至今1年了，案子仍卡在縣府。 農業局長張明聰指出，漁業署早於89年有意規劃雲林漁業權範圍，卻因雲林海岸線長約52公里，六輕、新興及四湖區等離島工業區，就占了三分之二，劃設困難，停頓至今。 張明聰說，縣府將先在四湖鄉以南、北港溪出海口以北的沿海，規劃3海里的多元化漁業發展區，讓養蚵漁民登記漁業權，目前向漁業署爭取規劃經費中，最快明年就會有結果。在漁業權規劃前，養殖漁民遭受天然災害損害，將提供復養補助，減少業者損失。