新的學年度才開始，各國立高中職卻要先為經費不足傷腦筋，有校長直言，自從省立高中改制為國立高中後，學校經費不增反減，甚至比縣立高中還不如。估計比精省前，一年少約120億元。 教育部中部辦公室副主任林樹全表示，精省前，各國立高中職資本門的預算一年有約145億元，現在一年的資本門預算只剩下約24億元。最主要的問題是立委審查教育預算時，是以統一刪除預算的方式，結果就造成國立高中職經費每年都減少約20至25%。今年還好爭取到一筆60億元的經費，要將專款用在整建老舊危險的高中職教室，否則部分老舊的高中職教室根本無錢整建。 據統計，精省後，各國立高中職的年度預算減少數百萬元至千萬元不等。教育部中部辦公室表示，整體的教育經費緊縮，分配到各縣市高中職的費用不得不減少，希望各學校開源節流，撙節運用。 桃竹地區一所國立高中校長說，今年學校經費比去年少了約500萬元，明年又會比今年少約1千萬元，最近學校因人事費用不足200多萬元，緊急向教育部中辦申請補助。 這位校長說，教育部原本給的人事費用雖是依教師員額計算，但未將老師的代課鐘點費等計入，原意是要學校省著花，但該給老師的薪水、鐘點費一毛都不能少，最後不足數還是要向教育部伸手。有時不得已，還得硬著頭皮請家長會支持費用。 另一所國立高中抱怨，全台約有10多所高中都設有音樂班，但從這學期起，教育部中部辦公室就不再補助音樂班個別授課鐘點費，過去一年大約每校要編200萬元，如果這筆錢要由家長負擔，大概每月每人要2.5萬元。學校到現在都還沒有告訴家長，不知要如何處理。教育部中部辦公室則說，因為整體費用減少，他們考量影響最小的方法就是刪除音樂班的這筆支出。 台北縣一所國立高中校長說，各省立高中職在89年改制為國立高中後，教育部並未在經費上特別支持，甚至有三年時間，國立高中職沒有資本門經費，亦即除了人事費等經常門開銷外，修繕、設備費等都沒有，或少得可憐。 這位校長表示，教育部對國立高中職冷淡對待，反觀台北縣政府，對縣立高中從獎學金設置到學校設備費、宣導費等，都很支持。國立高中雖有知名度較高、老師教學經驗較豐富等優勢，但如果硬體設備不能跟著更新，難保數年後不會被縣立中學超越，這是所有國立高中職都有的隱憂。