中華民國珊瑚礁學會去年底所作全台珊瑚礁總體檢報告指出，墾丁龍坑生態保護區珊瑚，受阿瑪斯號沉船殘骸破壞，覆蓋率三年多來減少百分之六十二點六，監察院已簽辦調查沈船殘骸為何仍未撈起的責任。 國科會去年九月委託中華民國珊瑚礁學會，動員海洋學者、潛水人員潛入綠島、墾丁龍坑、東沙、南沙太平島、澎湖南海等海域，調查水下環境，本月發表總體檢，發現墾丁龍坑海域因阿瑪斯號貨輪殘骸未清除，海底生態令人擔憂。 阿瑪斯號貨輪民國九十年一月在龍坑外海觸礁沉沒，迄今四年，已解體為兩百餘塊的大小殘骸。學會人員潛水調查發現，殘骸隨浪亂漂，把龍坑的海底珊瑚幾乎都撞斷。 珊瑚礁學會數據顯示，阿瑪斯號沈沒的當年七月，龍坑海域珊瑚礁覆蓋率是百分之八十七，隔年六月降為四十八點五，前年十月減為四十二點一，去年更降到廿四點五。沈船事件發生到去年總體檢，三年多來，龍坑珊瑚覆蓋率降了百分之六十二點六。 調查召集人海博館生物馴養組主任樊同雲說，船體殘骸散落離岸最近約四百公尺，最遠約一千四百公尺，分布範圍相當廣。他認為，假以時日或遇颱風，近海岸的部分殘骸有可能會被沖上岸，至於離岸較遠的大型殘骸，一動不如一靜，可當作人工漁礁。 樊同雲說，環保署曾要船公司打撈殘骸，但打撈船無法定泊，且經費預估要四百多萬美金，一直未進行。