民進黨在以往歷屆原住民立委選舉都抱蛋而歸，今年總算突破零紀錄。在賄選陰影下，由民進黨提名的平地原住民陳瑩終於順利當選，而馬團隊的國民黨山地原住民孔文吉首次參選，一舉打敗現任者，拿下山地原住民立委的最高票。 由於藍軍此次在山地原住民選區的主要作戰目標為：「力拱孔文吉上壘、拉下瓦歷斯貝林」。因此國民黨將卅個區塊中，分給孔文吉十八個，約佔山地原住民公民數的六成五，曾華德十二個，一度引發現任立委曾華德不滿，屢次向黨部強烈抗議。不過，為了讓孔文吉當選，國民黨並未理會。 而瓦歷斯貝林近來靠向綠營跡象明顯，包括總部成立時請陳水扁總統站台，都成為藍營攻擊的重點。國民黨幹部直言，瓦歷斯貝林當選，等於藍營少一席。他強調，瓦歷斯貝林實力堅強，不過，多數原住民都不滿綠營，倒向綠營使得瓦歷斯固票不易。 再者，瓦歷斯貝林與林春德、孔文吉均屬同選區，選票重疊，致瓦歷斯貝林選票未漲反退。 至於在平地原住民部份，蔡中涵落馬，陳瑩上榜，藍綠一落一上，讓藍軍輔選幹部甚為遺憾。 藍軍分析，蔡中涵長期擔任不分區，其擅長「經營票櫃」仍不敵疏於地方經營的劣勢。其次，蔡中涵過去票源泰半在都會區原住民，此次遭無盟宋進財搶食，也是關鍵。