新任教育部長杜正勝上任第一天，中華民國教育改革協會就發表公開信，期待杜正勝「恪守教育中立，敏於世界潮流」；全國教師會前秘書長吳忠泰也發表公開信，期待教長解決拼音爭議及中央地方權責劃分等問題。 公開信呼籲杜正勝能化解目前教育陣營對立氣氛、制定數位學習標準、採用公開格式的檔案，並提倡公共版權、防堵縣市挪用教育經費、幫移入人口解決教育問題並整合高中職課程等等。 教育改革協會表示，未來因為兩岸關係緊張，對美國交的「保護費」降不下來，加上政府租稅不公，對富人亂減稅所以政府的總收入也不易增加，在這幾項因素之下，未來教育經費不會增加，只能在原有的教育經費下，盡力發揮最大的購買力。 因此他們建議杜正勝應防堵縣市挪用教育經費，國庫給教育經費的方式也要改變，建立一個公平的競爭環境。 全國教師會前秘書長吳忠泰也發表公開信表示，行政院只是想用杜正勝勤於推動土本的「同心圓」理論，來建構台灣主體性的教育，以鞏固永續執政的目標，完全不把台灣永續發展的人力藍圖及教育資源放在眼裡，讓教育部變成一個有責接受各界責難、無權賞罰地方的「跛腳」行政部門，除非杜正勝能有深切體悟與行動，否則也難逃被行政院「工具化」的宿命。