水利署中區水資源局委託中興大學調查發現，雲林縣湖山水庫淹沒區八色鳥共有一百七十四隻，且族群穩定成長。水資局將建構綠帶緩衝區，並在三處最適合鳥類生長的林班地，營造八色鳥新家。 湖山水庫原訂五月動工，因執行淹沒區環評調查時間落差，疏漏八色鳥，引起國際鳥盟關切；農委會要求在未執行保護替代措施前，不同意解編保安林，迫使工程延後。為此，水資局委託中興大學生命科學系，利用夏季八色鳥飛抵台灣時，以兩個多月時間研究替代措施；報告已送林務局審查，通過後壩體工程即可發包動工。 報告指出，調查範圍與野鳥學會調查一致，包括阿里山事業區第六十一至七十三林班地，共兩千兩百八十五公頃，採錄放反應調查及定點計數法，共尋得廿七個鳥巢、一百七十四隻，比雲林縣野鳥學會兩年前調查的一百五十九隻還多。 水資局說，淹沒區並未列入八色鳥重要棲息環境劃設範圍，因此，替代措施將採取人為調控生態過程的建設性保育觀念，施工期將建構綠帶緩衝區；並在六十五至六十七林班地，建設最適合的棲地生態，同步進行系統性監測評估。 另外，除了辦理水庫周邊保護帶棲地復育及水庫蓄水後的保育措施，進行低海拔的棲地調查研究；水庫營運期也將辦理水庫周邊保護帶棲地復育計畫，由權責機關依法劃為水源保護區，進行集水區棲地長期監測與管理評估，採取必要的棲地改善工作。 湖山水庫工程費一百六十二億四千萬元，壩址位在斗六市、古坑鄉之間的北港溪支流梅林溪上游集水區。水資局為爭取時效，優先發包導水路及聯外道路工程。