國中、小教科書開放書商自由競爭，各校不再使用國立編譯館審定本後，家長反映學生出現課程無法連貫問題，質疑校方與書商勾結。市府政風室調查指出，國小部分除兩校未採用共同供應契約外，其餘各國中小教科書均採共同供應契約採購，並無違法情事。 部分家長向市府聯合服務中心陳情指出，各國中、小教科書年年更換不同版本，各年級部分內容重複，部分無法銜接，造成學生學習困擾，質疑學校每年換不同出版商的教科書，有官商勾結之嫌。 市府政風室對各校全面清查結果，指各國中、小使用的各年級教科書，均按教育局所訂「台南市公私立國民中小學辦理審定本教科書選用採購作業流程」辦理，由教務處蒐集或任課教師推薦各出版公司經審定合格的教科書樣本，國中部分經各科教學研究會，國小部分經學年會議，提列選擇版本書單，再由評審選購委員會審查，最後送校務會議評議，決定採用版本。 政風室表示，並無外界傳言每年更換版本，官商勾結圖利情形。 教育局表示，各科審定本教科書今年改為全國統一議價，除由教育局統一舉辦說明會外，另有個別書商到校辦試教說明會，各校教科書採用，依法規定由校務會議訂定辦法公開選用，教育局不能約束。