中經院董事長蕭萬長成為陳水扁總統經濟顧問小組召集人，另外，中經院還有兩名經濟專家，也已成為總統府高層的重要財經智囊。 中經院大陸經濟所所長田君美，不久前借調到副總統呂秀蓮辦公室，擔任一年的財經幕僚。據指出，田君美的夫婿、中研院社科所副研究員蔡吉源，在呂秀蓮擔任桃園縣長時，曾任桃園縣財政局長，因此，田君美與呂秀蓮稱得上是舊識。 借調副總統辦公室的田君美，已是呂秀蓮的財經左右手。呂秀蓮最近在總統府內一連串舉行多場因應後SARS時代研討會，都可看到田君美低調的身影。此外，也是由呂秀蓮主導的2003年創新科技系列研討會，副總統辦公室人員透露，田君美也有參與。 除了蕭萬長及田君美與總統府關係密切外，中經院人員也透露，中經院大陸經濟所研究員張佩珍，據傳最近也到國安會秘書長康寧祥辦公室幫忙，協助康寧祥掌握大陸經貿發展局勢。 不願具名人士指出，這次陳總統邀請六大工商團體及三大智庫負責人，商談SARS因應之道及成立總統經濟顧問小組，中經院、台灣智庫及台經院負責人都是受邀對象，但不見台綜院代表出席。未來國內主要財經智庫的政策影響力是否將產生消長變化，值得觀察。