王先生問：公司行號辦理薪資扣繳時，將員工的薪資計算錯誤，致溢扣員工的扣繳稅款，扣繳稅款也已向公庫繳納完畢，這筆溢繳稅款要如何處理？可否申請退還？ 南區國稅局臺南市分局答覆：依據所得稅法第94條及同法施行細則第96條規定，扣繳義務人於扣繳稅款時，如原扣繳稅額大於稽徵機關核定稅額時，扣繳義務人於繳納稅款後，應將溢扣之稅款，退還納稅義務人。 同時向公司所在地的國稅局所屬分局、稽徵所申請退還溢繳的稅款，或將該溢繳稅款留至同年度有應扣繳稅款時抵繳。但如遇到年度結束，僅可申請辦理退還溢繳稅款。