台北市立聯合醫院仁愛院區將負壓隔離病房當辦公室，雖是因應聯合醫院總部整修的權宜之計，衛生署醫事處處長薛瑞元說：「不論怎麼調整用途，既然登記的是病房，就該提供給病人使用，原則上不可以、也不應該當辦公室。」 為了收治SARS患者，國內101家醫院曾砸下大筆金錢，將一般病房改裝成負壓隔離病房，如今，SARS威脅暫退，負壓隔離病房可以調整用途嗎？薛瑞元表示，曾經在92年7月發函給醫院，負壓隔離病房除了收治SARS患者，可以收治觀察中的發燒患者或是呼吸道疾病的重症者，尤其以結核病患者為優先；也可向各縣市衛生局登記變更，暫時回復成一般病房使用。 疾病管理局院內感控組組長王華恭表示，負壓隔離病房不一定要打開負壓裝置，可以轉作收治結核病人的隔離病房；若是身為疾管局第三期「感染症防治醫療網」的責任醫院，由於接受補助，必須維護負壓隔離病房裡的設備，是可用的，一旦有大規模傳染病發生，就能立即啟動。王華恭說，疾管局不干涉院方使用負壓隔離病房的頻率，不過必須按月紀錄負壓表的數值，作為評鑑的標準。 第三期「感染症防治醫療網」成員大多為署立醫院，北市立醫院只有和平院區納入其中。不過王華恭認為，仁愛院區的作法並不恰當，除了SARS患者，包括結核病等容易傳染的疾病，負壓隔離病房都可發揮功用，醫院應該妥善運用。