爭議多年的代理孕母議題，迄今還未有結論，破天荒交付公民會議討論，企圖形成共識；但由於人工生殖法草案遲未通過，早年的人工生殖管理辦法又已失效，在這段法律真空期，若暗中以人工授精方式找人代孕，當事人及協助的醫師，也無法可管。 民國91年行政程序法通過後，所有民眾相關權利義務需立法規範，92年元月起，「人工生殖管理辦法」即已失效，而草擬的「人工生殖法」至今還沒邁出衛生署大門，完成立法也遙遙無期，更讓醫療院所人工生殖已無法源規範。 中原大學財經法系教授雷文玫昨在「代理孕母公民會議」中指出，在這段法律真空期中，雖然衛生署依醫療法第45條重新公告原有的管理辦法，以規範醫界，但若真有不孕夫妻找到代母，醫師以試管嬰兒技術，替委託之先生和太太的精、卵，植入代母子宮內，施術醫師可能會受罰；不過，若同時借了代母的卵子，僅以體外授精方式，將委託先生的精子，注入代母體內，則沒有任何法律可以處罰相關當事人。 雖然傳統民法精神為，誰分娩子女，誰即為該子女之母親。但雷文玫表示，若將委託先生的精子，以體外授精，讓代母受孕，除非醫療院所在產下胎兒的出生證明上造假，將母親改為委託太太，會觸犯偽文書罪；否則按實將代母列為小孩的母親，事後委託夫妻再透過認養方式，收養小孩，連提供精子的委託先生，因為讓代母受孕時並未與其發生性關係，連通姦罪都不成立。 人工生殖草案歷經三任衛生署長，最早的張博雅傾向禁止代理孕母，之後的詹啟賢態度大轉彎，傾向開放代母，現在的陳建仁則是將代母由人工生殖法草案脫勾。不過，行政院法規委員會主委陳美伶指出，儘管歷經三任署長，人工生殖法草案從未由衛生署送入行政院大門，早先曾有賴清德等立委提出立院版的人工生殖法，曾要求行政院應僅早提出對等版本，但衛生署還未提出，而立院現在屆期不續審的原則，新的會期開始後，立法院沒有任何人工生殖法的版本，一切歸零。