吳內閣今天上任，馬總統、吳敦義及朱立倫三巨頭今天下午五點舉行中外記者會，說明施政方針。內定總統府秘書長廖了以如完成任命程序，將一起出席記者會。 行政院長劉兆玄今天上午將率內閣總辭，新舊內閣隨即「無縫交接」，新任首長下午兩點在總統府宣誓就職，隨後舉行聯合交接，吳內閣隨即召開行政院臨時院會。 外界質疑劉內閣從「改組」翻盤成「總辭」，質疑馬、劉關係生變。總統府發言人王郁琦昨天舉行記者會強調，馬總統和劉兆玄公務上合作無間，默契很好，私底下也是非常好的朋友。 至於九月七日內閣總辭與宣布新任正副院長的安排，「這是馬劉共同商定，劉院長都充分理解。」 王郁琦說，八月中旬馬總統曾慰留劉兆玄，但因八八風災罹難者超過七百人，劉兆玄堅持負起政治責任去職，因此「八月中旬兩人達成共識，會在九月初的適當時機，劉院長會負起政治責任」，之所以未對外說明共識與默契，是希望讓內閣團隊盡心做災後安置與重建。馬總統與劉兆玄並未在內閣改組幅度出現歧見。 王郁琦說，馬總統六日晚間赴劉兆玄母親家，探視劉兆玄，是感謝劉過去這段時間的辛勞，並非「最後一次挽留」，劉兆玄母親僅跟馬總統說了「總統好」三個字，不是如媒體所稱「劉母懇託，成全兆玄辭職」。 面對媒體詢問，有沒有考慮過其他人選出任行政院長，王郁琦表示，只有總統最清楚徵詢過誰，既然是選擇吳敦義，就表示總統對吳敦義的能力是完全信任，「現在說曾經考慮過其他人選，是不重要且沒有意義的事。」