前中研院長、教育部長曾志朗將重新入閣，擔任新內閣政務委員。教育界人士認為，曾志朗出任政務委員，應該是劉兆玄安排，負責協助鄭瑞城的一顆棋，可以讓鄭瑞城就任後，很快上手。 曾志朗當初從陽明大學校長轉任教育部長時，陳水扁總統號稱曾是他「三顧茅蘆」請來的。但這位總統三顧茅蘆請來的教育部長，卻只做了21個月，任期不到兩年就為了漢語拼音被撤換下台，當時他還自比為「神鬼戰士」。有人認為，以曾志朗當過大學校長、教育部長、中研院副院長的資歷，這次只當行政院政務委員，「好像官愈當愈小」。但熟悉曾志朗的人卻覺得，曾志朗比較在乎能不能做事，位子對他其實並不是這麼重要。 一名不願具名的前教育部高層官員就說，新任教育部長鄭瑞城對中小學教育比較陌生，教育問題千頭萬緒，不是短短幾個月就能熟悉的，也因此鄭瑞城的政務次長，以及行政院負責教育事務的政務委員，相對非常重要。曾志朗再度入閣，外界認為，劉兆玄希望他協助推動教育事務的用心，非常明顯。