兩岸共同市場基金會成立於2001年3月26日，這是蕭萬長卸下行政院長後，在兩岸議題上搭建出的重要舞台。當年包括蕭萬長在內，還有19位捐助企業家，每人捐資500萬元，成就規模1億元的兩岸共同市場基金會。 兩岸共同市場基金會的捐助者以台灣企業家為主，包括：台積電董事長張忠謀、台新金董事長吳東亮、前台灣大董事長孫道存、台泥董事長辜成允、裕隆執行長嚴凱泰、統一集團董事長高清愿、元大證券集團總裁馬志玲及國泰金董事長蔡宏圖等人。